大會舉行了第二次全體會議。大會執行主席方偉、馬士光、王加培、胡建軍、盧剛、尹哲強、黃遠征、王先橋、李振峰、楊新忠、林小異、趙云燕、王東升在主席臺前排就座。省委組織部換屆工作督導組組長李健到會指導。
會議應到代表443人,實到代表426人,符合規定人數。
第二次全體會議舉行了兩場選舉。會議首先通過了《中國共產黨連云港市第十三次代表大會選舉辦法》。會議以無記名投票方式進行了差額選舉,51名同志當選為中國共產黨連云港市第十三屆委員會委員,9名同志當選為中國共產黨連云港市第十三屆委員會候補委員,31名同志當選為中國共產黨連云港市第十三屆紀律檢查委員會委員,39名同志當選為連云港市出席中國共產黨江蘇省第十四次代表大會代表。
大會通過了《中國共產黨連云港市第十三次代表大會關于中共連云港市第十二屆委員會報告的決議》和《中國共產黨連云港市第十三次代表大會關于中共連云港市第十二屆紀律檢查委員會工作報告的決議》。